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| Schéma de choanoflagellé | ||
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| Classification | ||
| Domaine | Eukaryota | |
| Sous-domaine | Unikonta | |
| Super-règne | Opisthokonta | |
| Règne | ||
| Choanomonada |
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| Familles de rang inférieur | ||
| Position phylogénétique | ||
| Groupe frère : Metazoa | ||
Les choanoflagellés (Choanomonada ou Choanoflagellata) forment un petit groupe d’Eukaryotes unicellulaires opisthocontes (avec 120 espèces connues), proches des métazoaires.
La cellule est caractérisée par la présence d'une collerette de microvillosités au centre de laquelle bat un flagelle (un appareil de Golgi se trouve à sa base), ainsi que par la sécrétion d'une loge ou thèque. On les rencontre principalement en milieu marin, de répartition mondiale puisque dans tous les océans, mais certaines espèces sont dulçaquicoles (d'eau douce). Les choanoflagellés sont planctoniques ou fixés sur des algues. Leur nourriture est constituée de bactéries essentiellement. Ils se nourrissent grâce à un mouvement du flagelle entraînant le déplacement de l'eau qui crée une dépression sur les bords de la collerette, qui conduit à une aspiration de l'eau apportant des bactéries au niveau de la collerette pour alimenter la cellule.
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