En taxinomie, un taxon (du grec τάξις / taxis, « placement », « mise en ordre ». Pluriel grec : taxa ; pluriel français : taxons) est une entité conceptuelle qui est censée regrouper tous les organismes vivants possédant en commun certains caractères taxinomiques ou diagnostiques bien définis. On voit donc, conformément aux définitions classiques de Simpson et de Mayr, qu'un taxon est un ensemble d'individus réels, et non un regroupement d'entités purement théoriques. Exemple : le taxon (l'espèce) désigné(e) sous le nom Canis familiaris renferme la totalité des chiens domestiques.
Dans la classification classique les caractères d'un taxon sont réputés homogènes en fonction de leur rang taxinomique, leur « poids » (valeur taxinomique relative) étant laissé à l'appréciation des systématiciens.
Dans les classifications plus modernes, comme la classification phylogénétique, beaucoup d'anciens taxons ne sont plus utilisés, car ils recouvrent des regroupements artificiels (paraphylétiques), ou encore des concepts vernaculaires (ex: reptile) insuffisamment structurés : on utilise des clades qui s'emboîtent les uns à l'intérieur des autres, correspondant en fait à des groupes monophylétiques.
L'espèce constitue le taxon de base de la classification systématique. Plus le rang du taxon est élevé et plus le degré de ressemblance (le nombre de caractères qu'ils ont en commun) des individus concernés (plantes, animaux, champignons, bactéries) est faible, et inversement.
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Le terme de taxinomie ne dérive pas du mot taxon, car ce dernier est un concept apparu bien plus récemment : Augustin Pyrame de Candolle aurait forgé le terme taxonomie en 1813 (corrigé plus tard par Littré en taxinomie selon l'étymon grec taxis), tandis qu'un autre botaniste, Lam, a créé le mot taxon en 1948. Ainsi, la taxinomie n'est pas l'étude des taxons mais bien les lois sur l'ordre, donc les règles de la classification.
En nomenclature traditionnelle (régie par les Codes de nomenclature), un taxon est :
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